Sekolah Tinggi Agama Islam Al Mujtama Pamekasan memiliki Visi, Misi, Tujuan dan Strategi yang dijadikan landasan dasar dalam menentukan arah dan tujuan institusi dalam mengimplementasikan tridarma perguruan tinggi, mulai dari Pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat, termasuk juga dalam bidang kerjasama. Karenanya, keberadaan visi dan misi Sekolah Tinggi Agama Islam Al Mujtamamampu menentukan posisi secara institusi di tengah-tengah para pemangku kepentingan seperti masyarakat umum, pergruan tinggi pesaing, serta sektor lapangan kerja seperti perusahaan dan instansi pemerintah.
Tujuan ditetapkannya Visi, Misi, Tujuan dan Strategi (VMTS) Sekolah Tinggi Agama Islam Al Mujtama adalah untuk merencanakan, menetapkan dan melaksanakan rencana pengembangan Sekolah Tinggi Agama Islam Al Mujtama ke depan sehingga dapat memberikan arahan dan menjadi inspirasi bagi stakeholder untuk menggerakan dan mengoptimalkan sumber daya yang dimiliki. Visi, Misi, Tujuan dan Strategi yang jelas sangat penting dalam menjalankan setiap organisasi, karena akan menggambarkan cita-cita bersama yang ingin dicapai dalam suatu periode tertentu.
Rasional secara eksternal adalah kebijakan Perguruan Tinggi yang tertulis pada Peraturan Pemerintah nomor 4 tahun 2014 tanggal 4 Februari 2014 tentang Penyelenggaraan Pendidikan Tinggi dan Pengelolaan Perguruan Tinggi dan Permendikbud nomor 03 Tahun 2020 tentang Standar Nasional Pendidikan Tinggi. Sedangkan landasan pada perpektif internal untuk mencapai visi, misi dan tujuan sebagai bagian dari Tridharma perguruan tinggi yang tertuang dalam Peraturan Yayasan Nomor: 069/AMT./D/II/2022 tentang Statuta Sekolah Tinggi Agama Islam Al Mujtama yang digunakan sebagai pedoman dalam menciptakan lulusan yang berkualitas dan sesuai dengan tujuan Sekolah Tinggi Agama Islam Al Mujtama.